Setelah Uzbekistan memerdekakan diri pada 1 September 1991 iaitu tiga bulan sebelum terbubarnya Kesatuan Soviet,[3] suatu pertandingan peringkat negara segera dilakukan mencari rekaan bendera terbaik untuk mewakili negara ini dengan sebanyak 200 masukan dinilai suatu jawatankuasa khas.[2][5]

Rekaan bendera kini dipilih dan dipakai secara rasmi pada November 18, 1991,[2] setelah mendapat persetujuan Soviet Agung Uzbek.[6][7] Rekaan bendera terawal ini tidak mempunyai bulan dan bintang-bintang khas ini langsung, kedua-dua unsur ini diletakkan pada bendera asal beberapa lama kemudian.[2]